Karšto bėgelio termoporų vidinis izoliacijos sluoksnis izoliuoja teigiamus ir neigiamus termoelektrinius laidus, kad būtų išvengta trumpojo jungimo{0}}gedimų, o išorinė apvalkalo izoliacija yra atspari aukštai temperatūrai, lydalo korozijai, alyvos taršai ir mechaninei trinčiai formų darbo aplinkoje. Skirtingos izoliacinės medžiagos turi skirtingą atsparumą temperatūrai, cheminį stabilumą ir mechaninį atsparumą, o tai tampa pagrindiniu veiksniu, lemiančiu termoporų eksploatavimo ciklą skirtingose karšto bėgelio naudojimo aplinkose. Pramonėje naudojamos pagrindinės izoliacinės medžiagos: mineralinė magnio oksido izoliacija, PTFE aukštos temperatūros plastikinė izoliacija, stiklo pluošto pynimo izoliacija ir žėručio apvijų izoliacija, kurių kiekviena turi išskirtinius karštojo bėgelio scenarijus.
Magnio oksidas (MI mineralinė izoliacija) yra standartinė užpildymo medžiaga, skirta įprastoms didelio našumo -termoporoms su karštu bėgeliu. Jis užpildomas ir sutankintas nerūdijančio plieno apvalkalo viduje, atskirai apvyniojant du pagrindinius termoelektrinius laidus. Magnio oksidas pasižymi puikiomis aukštos-temperatūros izoliacijos savybėmis, stabilia izoliacijos varža, viršijančia 1000 laipsnių, ir geru šilumos laidumu, todėl apvalkalo temperatūrą galima greitai perkelti į vidinio lydinio laidus, kad būtų užtikrintas aptikimas realiuoju laiku. Tuo pačiu metu kieta užpildymo konstrukcija gali tvirtai pritvirtinti vidinius laidus, išvengiant vidinio laido poslinkio ir lūžių, atsirandančių dėl pakartotinio lenkimo, pelėsių vibracijos ir terminio plėtimosi bei susitraukimo. Magnio oksido izoliacijos apribojimas yra tai, kad ji negali būti ilgą laiką veikiama drėgmės; drėgnas magnio oksidas smarkiai sumažės izoliacijos varža ir sukels trumpuosius jungimus. Todėl MI termoporos turi būti su sandariomis jungtimis, o atsargines dalis reikia laikyti sausoje aplinkoje. Visos spyruoklinės durtuvų termoporos, naudojamos aukščiausios klasės{10}}automobiliuose ir medicinos karštosiose bėgiuose, turi visą magnio oksido mineralinės izoliacijos struktūrą.
PTFE (politetrafluoretileno) izoliacija plačiai naudojama švariose{0}}kokybės ir žemos temperatūros{1}}karšto bėgelio termoporose. PTFE negamina nuodingų lakiųjų medžiagų esant aukštai temperatūrai, yra stiprus atsparumas korozijai rūgščių{3}}bazinių dujų lakiosioms medžiagoms, kurios nusodinamos lyjant plastikui, ir neišskirs šiukšlių, kad užterštų medicininius ir maisto produktus. Jo nuolatinis darbinės temperatūros diapazonas yra -20–260 laipsnių, todėl dažniausiai naudojamas termoporos išeinančių linijų išorinei laidų izoliacijai ir derinamas su medicininių vienkartinių gaminių formų mikro antgaliais. PTFE trūkumas yra prastas atsparumas aukštai temperatūrai; kai vietinė temperatūra ilgą laiką viršija 300 laipsnių, medžiaga suminkštės ir sensta, todėl izoliacijos sluoksnis išsilydys ir laidas trumpas. Todėl PTFE negali būti naudojamas kaip vidinė zondo užpildymo izoliacija šalia karšto bėgio šildymo zonos ir gali būti taikoma tik šalto galo laidų sekcijai už formos plokštės.
Stiklo pluošto pintinė izoliacija yra ekonomiškiausia{0}}bendroji izoliacinė medžiaga, skirta pradinio-lygio karšto bėgelio termoporoms. Jis pasižymi mažomis žaliavų sąnaudomis, tam tikru lankstumu ir gali atlaikyti ilgalaikę darbinę temperatūrą, žemesnę nei 550 laipsnių, o tai tinka J- tipo termoporoms įprastose pakuotėse karšto bėgio formoms. Stiklo pluošto trūkumai yra akivaizdūs: pintoje konstrukcijoje yra tarpų, kurie lengvai sugeria dirbtuvių alyvą, dulkes ir plastiko anglies nuosėdas, todėl po ilgo{7}}naudojimo sumažėja izoliacijos charakteristikos; pluoštas yra trapus, jį lengva lūžti ir nukristi pakartotinai sulenkus, todėl kabelio viduje susidaro laidžios šiukšlės, sukeliančios trumpąjį jungimą. Be to, dėvimas iš stiklo pluošto išskirs mažytes pluošto dulkes, kurios negali atitikti medicinos gamybos cechų higienos reikalavimų, todėl jis visiškai neįtrauktas į medicininius karšto bėgio daviklius.
Žėručio apvijų izoliacija dažniausiai naudojama specialioms ultra{0}}aukštos temperatūros karšto bėgio termoporoms, suderintoms su PEEK, LCP ir kitais aukštos temperatūros inžineriniais plastikais. Žėrutis gali atlaikyti momentinę temperatūrą, aukštesnę nei 1300 laipsnių, ir turi stabilų izoliacijos efektyvumą esant ilgalaikei-aukštos{5}}temperatūrai spinduliuotei. Jis dažnai vyniojamas ant storų termoporos lydinio laidų paviršiaus aukštos temperatūros purkštukuose. Tačiau žėručio lankstumas yra silpnas ir jį lengva įtrūkti sulenkus, todėl jo negalima naudoti mikro plono apvalkalo zondams, kuriuos reikia dažnai lenkti ir išardyti, ir gali būti naudojamas tik fiksuotoms tiesioms didelių kolektoriaus plokščių zondo konstrukcijoms.
Termoporos modelio pasirinkimo procese technikai pirmiausia turi įvertinti aukščiausią nuolatinę karšto bėgelio šildymo zonos temperatūrą ir gamybos aplinkosaugos standartus, kad pasirinktų tinkamas izoliacines medžiagas. Daugelį priešlaikinių termoporos gedimų ceche sukelia netinkamos izoliacinės medžiagos: pavyzdžiui, naudojant stiklo pluoštu izoliuotus zondus medicininėms formoms, gaminys užterštas; naudojant PTFE izoliuotus laidus, kurie tęsiasi į aukštos-temperatūros purkštukų zoną, izoliacija tirpsta ir įvyksta trumpasis jungimas. Protingas izoliacinių medžiagų suderinimas gali pailginti vidutinį karšto vamzdžio termoporų tarnavimo laiką daugiau nei 50% ir efektyviai sumažinti staigaus išjungimo, kurį sukelia izoliacijos pažeidimas, dažnumą.
